El ranking de universidades se ha elaborado a partir de la información reportada y validada del registro histórico de InCites (Web of Science) una de las más grandes bases de datos con altos estándares editoriales y científicos; así como con el registro oficial de patentes, administrado por el Instituto Nacional de Defensa de la Competencia y de la Protección de la Propiedad Intelectual (Indecopi).
La selección de indicadores está sustentada en la Ley Universitaria (Ley N° 30220) promulgada en el 2014 en su artículo 15 numeral 15.15, establece que la SUNEDU debe publicar un informe bienal sobre la realidad universitaria del país, el mismo que incluye un ranking universitario, respecto al número de publicaciones indexadas, entre otros indicadores. Así mismo, se analizaron antecedentes de diversos rankings internacionales de prestigio, tales como QS World University, Times Higher Education, Best Global Universities y Ranking América Economía, en los cuales incluyen a indicadores bibliométricos tales como la cantidad de publicaciones, impacto científico, excelencia internacional y número de patentes.
La metodología de este ranking considera el período 1980-2020 para los indicadores de producción científica, impacto científico y excelencia internacional. Asimismo, incluyó al número de patentes – invenciones y modelos de utilidad registradas en el Indecopi y vigentes al 1/10/2021. Dichos indicadores fueron estandarizados a una sóla unidad de medida, ponderados de acuerdo a sus pesos relativos y finalmente se realizó una normalización del conjunto de indicadores en un rango de 0 a 100.